Als u een nieuwe installatie van Spybot-S&D heeft kan u misschien enkele functies missen, zoals de sectie Toepassingen of Instellingen. Ze zijn niet verdwenen, maar Spybot-S&D heeft twee verschillende modi. Vanuit het item Mode in de menubalk hebt u de keuze tussen Standaard modus en Geavanceerde modus waar u de secties Toepassingen en Instellingen zal terugvinden.